昌宁澜沧江县级自然保护区位于澜沧江的中段,地跨怒江、澜沧江水系。保护区主要沿澜沧江两岸延伸,包括澜沧江西面的天堂山6511.8公顷、东面的老君山7048.2公顷,总面积13560公顷。保护区生态系统多样,同时拥有森林、湿地、草原植被,是全国西南生态安全屏障的重要组成部分。
澜沧江昌宁段是全球生物多样性地区之一,也是我国特有物种分布的地区之一,是重要的生物多样性宝库。保护区共记录兽类9目28科66种,其中国家级保护17种,包括穿山甲、蜂猴等I级重点保护动物8种,熊猴、猕猴等Ⅱ级重点保护动物9种。记录鸟类15目42科144种,包括国家级重点保护鸟类28种,其中I级保护鸟类黑颈长尾雉、绿孔雀、冠斑犀鸟3种,II级保护鸟类25种。两栖爬行动物4目12科54种。
保护区地貌复杂,古老类群丰富,天然植被分为7个植被型、8个植被亚型、38个群系,共有高等植物190科906属2183种。其中:有云南特有种植物81个,天堂大头茶和昌宁兰为独有种;有国家重点保护植物18种,包括国家Ⅰ级保护植物云南红豆杉、长蕊木兰2种,Ⅱ级保护植物中华桫椤、水青树等16种。